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[ Paquet source : tophat  ]

Paquet : tophat (2.0.6-1) [universe]

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Paquets similaires :

fast splice junction mapper for RNA-Seq reads

Autres paquets associés à tophat

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: dpkg (>= 1.15.6~)
    Debian package management system
  • dep: bowtie2
    ultrafast memory-efficient short read aligner
    ou bowtie
    ultrafast memory-efficient short read aligner
  • dep: libboost-thread1.49.0 (>= 1.49.0-1)
    portable C++ multi-threading
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    Embedded GNU C Library: Shared libraries
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7) [i386]
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1)
    GCC support library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.6)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: python (>= 2.6.6-3~)
    interactive high-level object-oriented language (default version)
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
    compression library - runtime
  • sug: bowtie
    ultrafast memory-efficient short read aligner
  • sug: cufflinks
    Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq

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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 621,5 ko3 636,0 ko [liste des fichiers]
i386 628,9 ko3 647,0 ko [liste des fichiers]