Skip to content
Sections
>> Ubuntu >> Пакеты >> feisty >> science >> kalign
feisty  ] [  gutsy  ] [  hardy  ] [  intrepid  ]
[ Исходник: kalign  ]

Пакет: kalign (1.04-1) [universe]

Ссылки для kalign

Ресурсы Ubuntu:

Загрузка пакета исходного кода kalign:

Сопровождающий:

Please consider filing a bug or asking a question via Launchpad before contacting the maintainer directly.

Original Maintainers (usually from Debian):

It should generally not be necessary for users to contact the original maintainer.

Подобные пакеты:

Global and progressive multiple sequence alignment

Kalign is a command line tool to perform multiple alignment of biological sequences. It employs the Wu-Manber string-matching algorithm, to improve both the accuracy and speed of the alignment. It uses global, progressive alignment approach, enriched by employing an approximate string-matching algorithm to calculate sequence distances and by incorporating local matches into the otherwise global alignment. In comparisons made by its authors, Kalign was about 10 times faster than ClustalW and, depending on the alignment size, up to 50 times faster than popular iterative methods. It has been published in Lassmann and Sonnhammer, BMC Bioinformatics 2005, 6:298.

 Homepage: http://msa.cgb.ki.se

Другие пакеты, относящиеся к kalign

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.4-1)
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

Загрузка kalign

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 33,6 Кб116 Кб [список файлов]
i386 30,1 Кб116 Кб [список файлов]
powerpc 38,1 Кб116 Кб [список файлов]