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[ Paquet source : tophat  ]

Paquet : tophat (2.1.1+dfsg1-1) [universe]

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Paquets similaires :

fast splice junction mapper for RNA-Seq reads

Autres paquets associés à tophat

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • enhances
  • dep: bowtie2
    ultrafast memory-efficient short read aligner
    ou bowtie
    Ultrafast memory-efficient short read aligner
  • dep: libboost-system1.65.1
    Operating system (e.g. diagnostics support) library
  • dep: libboost-thread1.65.1
    portable C++ multi-threading
  • dep: libc6 (>= 2.15) [amd64, s390x]
    GNU C Library: Shared libraries
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
  • dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
    GCC support library
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: python
    interactive high-level object-oriented language (default version)
  • dep: samtools (>= 1.5)
    processing sequence alignments in SAM and BAM formats
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
    compression library - runtime
  • sug: cufflinks
    Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq

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Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 659,8 ko3 807,0 ko [liste des fichiers]
arm64 594,0 ko3 566,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 726,6 ko5 424,0 ko [liste des fichiers]
s390x 598,2 ko4 066,0 ko [liste des fichiers]