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[ ソース: circlator  ]

パッケージ: circlator (1.5.5-1) [universe]

circlator に関するリンク


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circlator ソースパッケージをダウンロード:


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Original Maintainers (usually from Debian):

It should generally not be necessary for users to contact the original maintainer.



circularize genome assemblies

その他の circlator 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • enhances
  • dep: bwa (>= 0.7.12)
    Burrows-Wheeler Aligner
  • dep: fastaq (>= 3.12.1)
    FASTA and FASTQ file manipulation tools
  • dep: mummer
    Efficient sequence alignment of full genomes
  • dep: prodigal
    Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: python3-openpyxl
    Python 3 module to read/write OpenXML xlsx/xlsm files
  • dep: python3-pymummer (>= 0.9.0)
    Python 3 interface to MUMmer
  • dep: python3-pysam (>= 0.8.1)
    interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
  • dep: samtools
    processing sequence alignments in SAM and BAM formats
  • dep: spades
    genome assembler for single-cell and isolates data sets
  • sug: canu
    single molecule sequence assembler for genomes

circlator のダウンロード

アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
all 4,225.1 kB10,301.0 kB [ファイル一覧]