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Paquet : nanook (1.33+dfsg-1) [universe]

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pre- and post-alignment analysis of nanopore sequencing data

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enhances

dep: default-jre-headless

Standard Java or Java compatible Runtime (headless)
dep: hdf5-tools

Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - Runtime tools
dep: last-align

genome-scale comparison of biological sequences
dep: libcommons-io-java

Common useful IO related classes
dep: r-cran-ggplot2

implementation of the Grammar of Graphics
dep: r-cran-gridextra

GNU R package with extensions for the grid package
dep: r-cran-reshape

Flexibly reshape data
dep: r-cran-scales

Scale functions for visualization
dep: texlive-latex-base

TeX Live: LaTeX fundamental packages

rec: blasr

mapping single-molecule sequencing reads
rec: bwa

Burrows-Wheeler Aligner

sug: default-jre

Standard Java or Java compatible Runtime

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