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[ Paquet source : sga  ]

Paquet : sga (0.10.15-7build1) [universe]

Liens pour sga

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Please consider filing a bug or asking a question via Launchpad before contacting the maintainer directly.

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It should generally not be necessary for users to contact the original maintainer.

Ressources externes :

Paquets similaires :

de novo genome assembler that uses string graphs

Autres paquets associés à sga

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • enhances
  • dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)
    dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
    GCC support library
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: perl
    Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: python3-pysam
    interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
  • dep: python3-ruffus
    Python3 computation pipeline library widely used in bioinformatics
  • dep: samtools
    processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime
  • rec: abyss
    de novo, parallel, sequence assembler for short reads

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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
arm64 71,4 ko253,0 ko [liste des fichiers]