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ソースパッケージ: cnvkit (0.9.10-1) [universe]

cnvkit に関するリンク

Ubuntu の資源:

メンテナ:

Please consider filing a bug or asking a question via Launchpad before contacting the maintainer directly.

Original Maintainers (usually from Debian):

It should generally not be necessary for users to contact the original maintainer.

外部の資源:

以下のバイナリパッケージがこのソースパッケージからビルドされています。
cnvkit
Copy number variant detection from targeted DNA sequencing

その他の cnvkit 関連パッケージ

  • 構築依存
  • 構築依存 (アーキテクチャ非依存)
  • adep: debhelper-compat (= 13)
    パッケージは利用できません
  • adep: dh-sequence-python3
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: dh-python
  • adep: python3-all
    package depending on all supported Python 3 runtime versions
  • adep: python3-setuptools
    Python3 Distutils Enhancements
  • adep: python3-pytest
    Simple, powerful testing in Python3
  • adep: python3-pyfaidx
    efficient random access to fasta subsequences for Python 3
  • adep: python3-biopython
    Python3 library for bioinformatics
  • adep: python3-pandas
    data structures for "relational" or "labeled" data
  • adep: python3-numpy
    Fast array facility to the Python language (Python 3)
  • adep: python3-pysam
    interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
  • adep: python3-scipy
    scientific tools for Python 3
  • adep: python3-matplotlib
    Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
  • adep: python3-pomegranate
    Fast, flexible and easy to use probabilistic modelling
  • adep: r-bioc-dnacopy
    R package: DNA copy number data analysis
  • adep: poppler-utils
    PDF utilities (based on Poppler)

Download cnvkit

ファイルサイズ (単位: kB)MD5 チェックサム
cnvkit_0.9.10-1.dsc 2.4 kB 869f0a16fee2cbe9abd9b60e6bd36e4b
cnvkit_0.9.10.orig.tar.gz 23,108.4 kB ac1e8d636fc0fc694d1475a212d0cf98
cnvkit_0.9.10-1.debian.tar.xz 17.0 kB 2cb3b7baefb56912532b59ac320e0425
Debian パッケージソースリポジトリ (VCS: Git)
https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit.git
Debian パッケージソースリポジトリ (ブラウザで表示可能)
https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit